尽管应用程序数量最多的是 Google Play，但 App Store 才是开发人员最看重的商店，主要是上架到 App Store 的应用程序能够更好的转换为金钱。2016 年第四季度 App Store 高达 54 亿美元的营收就是最好的证明，而同一时期 Google Play 的营收仅为 33 亿美元。在两个应用程序商店的开发者分成都是 70% 的情况下，应用程序数量比 Google Play 更少的 App Store，能够产生的收入自然更多。
很多第三方的报告已经表明，iOS 用户不介意为应用程序付费，哪怕是再多付一些内购的费用。而 Google Play 商店的情况则完全不同，在同一类别中相互竞争的应用程序非常多，为此开发人员往往免费提供应用程序，以便能吸引到更多的用户使用。
免费应用程序对用而言是好事，对开发者则不然。为了能够通过应用程序获利，很多时候开发者不得不内嵌广告，但此举又不得不面对一些相较纯净的应用程序的竞争。App Store 的规模确实没有 Google Play 那么大，不过竞争环境相对而言更好。用户并不介意每个月为应用花几块或十几块钱 ，而在 Google Play 商店中，用户更多会寻找同类免费的替代品。
即搜即得应用和 Beta 测试版
当然了，Google Play 不是没有优势，这两个就是优势之二。其实在安装应用方面，Google Play 已便捷不少，只要你有 Google Play 账户，就可以通过商店轻松将应用程序同时推送到设备上安装，并且手机和平板电脑端同时安装。而如果你要在 iPhone 和 iPad 上安装相同的应用程序，只能手动分别在两款设备安装，这是比较明显的差异。
所谓即搜即得应用，是谷歌为 Google Play 开发者打造的 Instant Apps 功能，此类是分享和发现方式的进化，无需下载安装就能够立即运行，只要通过搜索、社交网络、消息传递链接碰到这类应用，点一下就能够直接体验应用了，而且此类应用仍保持简洁美观的界面，优异的性能和强大的功能。目前苹果 iOS 用不还不具备此功能，仍需跳转到 App Store 安装完整版本。
另外，Google Play 也为允许开发者为用户提供 Beta 测试版的应用程序，便于追新的用户率先体验到新的功能，或者进行测试反馈。考虑到测试版大多数情况下仍不稳定，用户也可以选择放弃使用 Beta 测试应用。同样，这个功能 iOS 平台暂时还未提供，普通用户只能通过联系企业获取证书的形式安装测试。
应用种类
世界范围内有大量采用 Android 操作系统的智能手机和平板电脑，配置上差异很大，尺寸不同，CPU 不同，运行内存也不同。Android 开发者的应用程序只能考虑尽可能兼容更多的设备。在 iOS 平台上则相反，大量应用程序都能很好的在 iPhone 和 iPad 上运行，只是部分 iPhone 专属或 iPad 专属而已，仅有小部分没有适配好 iPad 。
就应用类别来说，Google Play 和 App Store 分类都不少，教育、生活、娱乐和个性化类别是 Google Play 商店较为流行的分类，找到满足需求的应用不难。几乎相同的情况也出现在 App Store，不过苹果推荐应用程序的更倾向于游戏，毕竟通过游戏带来的收入占比相当大。任天堂看重的正是这一点，《超级马里奥跑酷》去年 9 月份就登陆 iOS 了， 至今暂时还未有 Android 版本。
说实话，为了最大限度的扩大应用程序的影响力，不少开发者同时推出了 iOS 和 Android 版本的应用，若从功能性来说 Google Play 应用程序略多一些，因为很多 Android 应用可以利用到系统更深权限的功能，甚至是 Root 之后的功能。
评价和退款
搜索应用程序在 Google Play 上效率更高，谷歌本身就是做搜索的，在高效搜索算法上有过人之处。谷歌还将 Google+ 社交功能集成入内，所以在你看应用程序评价时，来自 Google + 好友的评论会出现在顶部，很多时候来自朋友的推荐和体验感受，比所有陌生人的评价更易于了解应用。
苹果的 App Store 比较有意的将 4 星或更高评级的应用程序推到搜索结果前面，使用户更容易发现更好的应用程序，但在通过关键字查找应用方面确实略逊于 Google Play。另外，App Store 只允许开发者在一年内弹框要求用户评级三次，而 Google Play 下载的应用通常不断要求用户评级。
在退款方面，Google Play 允许用户在购买应用程序之后的 2 小时之内退款，此退款政策不如 App Store 那么有吸引力，iOS 设备用户通过报告问题即可选择退款， 大多数 90 天内购买的应用程序都能通过适当的理由退款，只有部分需联系开发商。
安全
普遍的评论认为，App Store 更加安全，因为苹果通常需要花费大量的时间来逐个排查应用程序，但这只是应用上架前必走的步骤之一，苹果审查一个应用程序再到提供评级，整个过程可能需要一个多星期，基本上所有应用程序都要遵循相同的准则。
看过一份来自 App Brain 的数据显示，Google Play 商店上个月低质量的应用高达 33.7 万个，但 iOS 却没有提供这样的数字。虽然低质量不代表应用程序一定包含恶意软件，但对应用体验而言却是灾难性的。说实话，为了加快应用程序上架的速度，只要符合 Android 开发指导方针，应用很快就能通过审查上架，所以之前已经有过恶意应用的情况，而且谷歌往往只移除已经被报告多次的应用。
不过，苹果审查的时间久，也不一定代表应用程序足够安全，之前因为 XcodeGhost 恶意软件的事件就是最好的例子。当时超过 4000 个应用遭到感染，特别是在中国区，因为国人通常为了节省时间，直接下载来自第三方网站的软件，没有意识到实际这一开发工具并不安全。
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